旗山位於高雄市中央，東毗美濃、西連田寮、南接屏東縣里港鄉、北鄰杉林。全境概居北迴歸線以南，屬低緯熱帶季風區，年約溫攝氏24-28度。地形位於屏東平原北端，南北長約30公里，東西寬約10公里，大部分地區為丘陵地，三面群山環抱，楠梓仙溪從中流過，川溪交流。
旗山行政轄區含21里，分別為太平里、大德里、湄洲里、竹峰里、瑞吉里、永和里、三協里、圓富里、中正里、大林里、上洲里、鯤洲里、大山里、中洲里、南洲里、新光里、中寮里、南勝里、東平里、東昌里及廣福里，人口數約40,000人，由於地形南北縱走，人文重心聚集於旗南、旗甲、延平、中山路沿線。
衛生所是執行基層醫療保健服務的衛生單位，綜合處理衛生保健、防疫、衛生行政與醫療等業務，主要工作項目及業務為醫療服務(包括門診醫療服務、健康檢查、醫療檢驗檢查、緊急救護和行政相驗工作)、衛生保健服務(包括婦幼衛生、中老年慢性病防治、緊急救護、傳染病防治、癌症防治及心理衛生等工作)與衛生行政工作(包括醫政事務、藥政、食品衛生及營業衛生管理等工作)，肩負提供轄境內民眾公共衛生服務，藉深入社區與民眾接觸之機會，推動各項公共衛生、保健防疫與衛教宣導工作與社會責任，是親近民眾的好鄰居與健康福祉的尖兵。
民國六十六年因本轄境內醫療資源不足，為民眾健康保健計，開辦醫療門診服務，並與中央健康保險局合約提供健保服務，同時結合公共衛生推動工作，為民眾健康促進把關。民國八十五年經行政院衛生署擴大醫療資訊服務，建置「門診醫療及保健個案系統」(簡稱PHIS系統)，本所全面電腦資訊化處理門診醫療資料處理，提升醫療資訊與行政效率。
民眾的健康是衛生所責無旁貸的工作，唯有因應社會不斷進步的複雜環境，建立危機意識，創造願景與擬定達成願景的相關策略，領導衛生所團隊推展公共衛生與保健工作，以更親近民眾提供貼心的服務。